8違規收費
環保部轉嫁會議費
2011年度審計報告曾“點名”批評國土資源部、環保部的違規收費“屢審屢犯”現象。
報告中指出，2010年審計，已責成國土資源部所屬礦產資源儲量評審中心停止違規收取礦產資源儲量評審服務費，但“本次審計發現這項收費仍未停止，也未另行解決經費來源，2011年收費1064.24萬元”。
“以前年度審計指出的環保部核安全中心違規變相收費問題仍未糾正”，報告中說，“2010年至2011年，該中心以核電廠建設前期設計研究名義與有關單位簽訂收費服務合同金額共4356萬元，已收款1343萬元﹔以中國環境科學學會的名義與6家公司簽訂收費技術咨詢合同金額共240萬元﹔向評審對象轉嫁會議費和專家咨詢費等約900萬元”。
同樣違規收費“屢查屢犯”的還有財政部、住建部、水利部、原鐵道部、知識產權局、貿促會等6部門及其所屬單位。
9違規招投標
商務部議標招承包方
為杜絕商業賄賂、貪污腐敗等行為，國家制定了嚴格的政府採購和招投標等規定。但過去5年，商務部、文化部、環保部、住建部、知識產權局、全國社會保障基金理事會等6單位，多次被查出違規招投標。
商務部2008年被查出，將應公開招標的項目，以議標方式選定了施工總承包企業。2012年，商務部再次被查出，部分項目支出共5941.38萬元未按規定公開招標。
住建部2010年被查出，該部住房保障司的“保障性安居工程統計報表信息系統”項目，以邀請招標的方式確定中標單位，中標金額198萬元。
環保部2011年被查出，所屬中國環境監測總站、環境規劃院、衛星環境應用中心，招投標時或未公開招標，或被投標人以串通投標方式中標，涉及金額總計1720萬元。
此外，各年度報告還曝出國土資源部、國家體育總局、外交部、海關總署、國家旅游局、國家測繪局等6單位及其所屬單位的規避招投標“技巧”。
10假發票入賬
出版總署4000萬發票違規
過去5年，科技部和國家新聞出版總署，都曾兩度被查出假發票或不規范發票入賬問題。
科技部2010年被查出，所屬北京航空航天大學收受兩家工程承擔單位提供的12張假發票入賬，票面金額共計433.51萬元。2012年又被查出，科技部部本級使用收款單位提供的已作廢資金往來收據入賬，涉及金額17萬元﹔所屬機關服務中心使用施工單位提供的兩張假發票入賬，涉及金額12.37萬元。
國家新聞出版總署2009年被查出，支付的4212.80萬元出版費用，未取得符合規定的發票﹔2010年又被查出，署本級及所屬信息中心的報賬憑証中，有業務真實但憑據虛假的發票432張，金額共149.9萬元。
事實上，假發票或不規范發票入賬，也一直是審計“頑疾”之一。
2009年度，發改委、公安部、人社部、國土資源部、衛生部、央行、國資委等16個單位，不規范發票、假發票共計約涉及金額5368.14萬元。
2010年度，外交部、農業部、工商總局、國防科工局等6單位，不規范發票、假發票共計約涉及金額1796.27萬元。
2011年度，國家民委、住建部、貿促會等5單位，不規范發票、假發票共計約涉及金額1088.85萬元。
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